В настоящее время официально существует две последние версии программы. Первая была выпущена 26 мая 2003 года, и в ней была введена возможность, предоставляющая возможность браузеру подключаться в обход прокси, если этот прокси не отвечает после нескольких попыток. Введение этой возможности вызвало в конференции Yahoo столь отрицательную реакцию со стороны некоторых её участников, что автор не выдержал и решил прекратить разработку. Последнее сообщение автора смотрите здесь - из него многое становится понятно.
Теперь эта версия, по инициативе авторов сайта www.proxomitron.info, называется Proxomitron 4.5m (may).

Тем не менее, спустя несколько дней (1 июня 2003 года), автор всё же решил выпустить патч (фактически, просто файл программы), в котором эта функция отключена. Для удобства был собран еще один дистрибутив, основанный на этой версии. Он называется Proxomitron 4.5j (june).

Решение, какую версию программы использовать, остается за вами. Но можно сказать, что майскую версию имеет смысл ставить только в одном случае: если вы широко используете прокси, но вопросы анонимности вас не беспокоят. Во все остальных случаях разумнее остановиться на июньской версии.